Berkat rahmat Allah SWT dan didorong oleh keinginan luhur untuk mensukseskan pembangunan Kabupaten Rokan Hulu yang baru dimekarkan pada tanggal 12 Oktober 1999 berdasarkan UU Nomor 53 tahun 1999, serta komitmen akan tanggung jawab tokoh-tokoh Kabupaten Rokan Hulu melalui peningkatan kualitas sumber daya manusia pada sektor pendidikan. Dengan landasan tersebut maka berdirilah Yayasan Penelitian dan Perencanaan Pembangunan Daerah (YP3D) pada tanggal 30 Juni 2000 (akta notaris Mohamad Dahad Umar, SH No 57) dan terdaftar pada pengadilan negeri Pekanbaru No. 104/2000/YYS tertanggal 5 September 2000.
Para pendiri dan Pengurus YP3D
H. Ramlan Zas Datuk Tumenggung, SH
| H. Masperi, S.Sos
| H.Muzawir, SH
| Alilius,
Fakhrizal, SH
| Drs. Jasmet
| Drs. Muchtar Mariso
| Dr.Ir.Irwan Efendi, MSc
Drs. Ridwan Melay, M.Hum
| Drs. Ali Yusri, Msc
| Amrun, SH
| Drs. Azhari Zakri
Prof. Dr. Ir. Feliatra, DEA
| Hasrizal Hasan, SE
| Drs. Usman Malik, MSc
| Ir. Alfian Kamaldi, MT
| H. Masperi, S.Sos
| H.Muzawir, SH
| Alilius,
Fakhrizal, SH
| Drs. Jasmet
| Drs. Muchtar Mariso
| Dr.Ir.Irwan Efendi, MSc
Drs. Ridwan Melay, M.Hum
| Drs. Ali Yusri, Msc
| Amrun, SH
| Drs. Azhari Zakri
Prof. Dr. Ir. Feliatra, DEA
| Hasrizal Hasan, SE
| Drs. Usman Malik, MSc
| Ir. Alfian Kamaldi, MT
Untuk mengimplementasikan keinginan luhur para pendiri yayasan maka YP3D pada tanggal 2 Agustus 2002 mendirikan Politeknik Pasir Pengaraian (POLIPERA) dengan 6 program studi yaitu Program Studi Akuntansi, Administrasi Bisnis, Agrobisnis, Kontruksi Sipil, Mesin dan Peralatan Pertanian dan Teknik Elektronika sesuai dengan SK Mentri Pendidikan Nasional Republik Indonesia Nomor: 166/D/O/2002. Sebagai direktur pertama POLIPERA adalah Bapak Ir. Alfian Kamaldi, MT dari 2002 – 2004.
Kemudian dengan landasan cita-cita luhur para pendiri YP3D untuk turut mengabdi tanpa pamrih di Kabupaten Rokan Hulu, untuk ikut serta dalam peningkatan kualitas sumber daya manusia dan penyesuaian anggaran dasar YP3D dengan Undang-undang Yayasan No 16 tahun 2001, maka YP3D dirubah menjadi Yayasan Pembangunan Rokan Hulu (YPRH) pada tanggal 24 Mei 2004 (akta notaris Yusrizal, SH No. 111), dengan susunan kepengurusan sebagai berikut:
| Pembina:
| | Prof. Dr. Ir. H. Feliatra, DEA
| | Hasrizal Hasan, SE
| | Amrun, SH
| Pengurus:
| | Ketua Umum
| | | : Wakil Bendahara
| | Ketua
| | | : Drs, H. Muchtar Mariso
| | Wakil Ketua
| | | : Dr. Ir. Irwan Efendi, M.Sc
| | Sekretarsi Umum
| | | : H. Masperi, S.Sos
| | Sekretaris
| | | : Drs. Ali Yusri, M.Sc
| | Wakil Sekretaris
| | | : Drs. Ridwan Melay, M.Hum
| | Bendahara Umum
| | | : H. Muzawir, SH
| | Bendahara
| | | : Drs. Azhari Zakri
| | Wakil Bendahara
| | | : Drs. Usman Malik, M.Sc
| | Pengawas:
| | | Alilius
| | | Fakhrizal, SH
| | | Drs. Jasmet
| | Prof. Dr. Ir. H. Feliatra, DEA
| | Hasrizal Hasan, SE
| | Amrun, SH
| Pengurus:
| | Ketua Umum
| | | : Wakil Bendahara
| | Ketua
| | | : Drs, H. Muchtar Mariso
| | Wakil Ketua
| | | : Dr. Ir. Irwan Efendi, M.Sc
| | Sekretarsi Umum
| | | : H. Masperi, S.Sos
| | Sekretaris
| | | : Drs. Ali Yusri, M.Sc
| | Wakil Sekretaris
| | | : Drs. Ridwan Melay, M.Hum
| | Bendahara Umum
| | | : H. Muzawir, SH
| | Bendahara
| | | : Drs. Azhari Zakri
| | Wakil Bendahara
| | | : Drs. Usman Malik, M.Sc
| | Pengawas:
| | | Alilius
| | | Fakhrizal, SH
| | | Drs. Jasmet
Dengan kepengurusan baru maka direktur POLIPERA pada tahun 2004 diganti dengan Bapak Prof. Drs. Mukhtar Rahman sampai dengan tahun 2006. Untuk meneruskan kepemimpinan di POLIPERA, selanjutnya direktur yang ketiga adalah Bapak Prof. Dr.Ir. H. Feliatra, DEA dari tahun 2006 sampai dengan tahun 2009.
Dengan berkembangnya Kabupaten Rokan Hulu dan kebutuhan akan sumber daya manusia bidang kesehatan maka selanjutnya pada tanggal 19 Juli 2007 didirikan pula Akademi Kebidanan (AKBIDPAPE) sesuai dengan SK Mentri Pendidikan Nasional Republik Indonesia Nomor: 112/D/O/2007 yang berkedudukan di Pasir Pengaraian dengan direktur di rangkap oleh Prof. Dr.Ir. H. Feliatra, DEA.
Sejalan dengan tujuan pendidikan sebagaimana tertuang dalam Undang-Undang Nomor 20 tahun 2003 tentang Sistem Pendidikan Nasional, Pasal 3, POLIPERA dan AKBIDPAPE tersebut melebur menjadi UNIVERSITAS PASIR PENGARAIAN (UPP) sesuai SK Mentri Pendidikan Nasional Republik Indonesia Nomor: 121/D/O/2009 pada tanggal 03 Agustus 2009. UPP didirikan bertujuan menyiapkan peserta didik menjadi anggota masyarakat yang beriman dan bertaqwa terhadap Allah SWT, berakhlaq mulia, percaya pada diri sendiri, memiliki kemampuan akademik dan/atau menciptakan teori-teori baru dibidang ilmu pendidikan dan keguruan maupun ilmu pengetahuan lain, mengembangkan dan menyebarluaskan ilmu pengetahuan tersebut, serta mengupayakan pemanfaatannya untuk meningkatkan taraf kehidupan masyarakat dan kesejahteraan umat manusia. Adapun rektor UPP Pertama kali di jabat oleh Prof. Dr.Ir. H. Feliatra, DEA dari tahun 2009 sampai tahun 2010.
Untuk peningkatan dan penyegaran kinerja kemudian pada tahun 2009 YPRH melakukan restrukturisasi kepengurusan (akta notaris Yandri, SH No. 02) dengan surat keputusan menteri Hukum dan Hak Asasi Manusia Republik Indonesia No. AHU.-4784.AH.01.04. tahun 2010 dengan susunan pengurus YPRH sebagai berikut:
| Pembina:
| Drs, H. Muchtar Mariso
| Drs. Ridwan Melay, M.Hum
| H. Muzawir, SH
| Pengurus:
| | Ketua Umum
| | | : Dr. Ir. Irwan Efendi, M.Sc | Ketua Umum
| | | : Drs. Azhari Zakri, M.Pd | Anggota
| | | : Prof. Dr. Ir. H. Feliatra, DEA | Anggota
| | Sekretaris
| | | : Drs. Jahrizal, MT | Sekretaris
| | | : Drs. Usman Malik, M.Sc | Anggota
| | Bendahara
| | | : Hasrizal Hasan, SE., MM | Bendahara
| | | : Amrun, SH.,MM | Anggota
| | Pengawas:
| | | Drs. H. Ali Yusri, M.Sc |
| | | H. Masperi, S.Sos., M.Sos Fakhrizal, SH |
| Drs, H. Muchtar Mariso
| Drs. Ridwan Melay, M.Hum
| H. Muzawir, SH
| Pengurus:
| | Ketua Umum
| | | : Dr. Ir. Irwan Efendi, M.Sc | Ketua Umum
| | | : Drs. Azhari Zakri, M.Pd | Anggota
| | | : Prof. Dr. Ir. H. Feliatra, DEA | Anggota
| | Sekretaris
| | | : Drs. Jahrizal, MT | Sekretaris
| | | : Drs. Usman Malik, M.Sc | Anggota
| | Bendahara
| | | : Hasrizal Hasan, SE., MM | Bendahara
| | | : Amrun, SH.,MM | Anggota
| | Pengawas:
| | | Drs. H. Ali Yusri, M.Sc |
| | | H. Masperi, S.Sos., M.Sos Fakhrizal, SH |
Setelah restrukturisasi kepengurusan YPRH maka Rektor UPP selanjutnya adalah Bapak Dr.Ir.H. Syafrudin Nasution, M.Sc dengan masa tugas dari tanggal 17 Mei 2010 sampai 12 Desember 2011. Atas kebijaksanaan pimpinan YPRH dalam rangka peningkatan kinerja pimpinan di UPP, maka kemudian dilakukan restrukturisasi kepemimpinan UPP. Maka sebagai pelaksana tugas Rektor UPP ditunjuk Bapak Drs. Ali Yusri, M.Sc mulai dari tanggal 12 Desember 2011 sampai dengan tanggal 27 Juni 2012. Setelah masa pelaksana tugaas rektor Drs. Ali Yusri, M.Sc berakhir maka untuk melanjutkan pelaksana tugas rektor UPP, YPRH menunjuk Prof. Dr. Ir. H. Feliatra, DEA. Pada Tanggal tanggal 12 Juli 2012 Pengurus YPRH melakukan restrukturisasi kepengurusan karena ada beberapa pengurus yang mengundurkan diri (surat Pengunduran diri No. 21-4/TU/YPRH/VI/2012), sehingga pengurus YPRH yang terbaru (akta notaris Juli Rahayu, SH., MKn No.29) adalah sebagai berikut:
1. Pembina Ketua : Drs. H. Achmad, M.Sc. Anggota : Ir. H. Hafith Syukri, MM. Anggota : Drs. Tengku Habrizal
2. Pengurus: Ketua : Ir. Damri Sekretaris : H. Muhammad Zein, M.Pd. Wakil Sekretaris : Abdul Haris, S.Sos Bendahara : Jaharuddin, SP., MM.
3. Pengawas: Prof. Dr. Ir. Irwan Efendi, M.Sc. Drs. H. Ali Yusri, M.Sc.
Setelah Restrukturisasi kepengurusan YPRH maka Rektor difinitif UPP adalah bapak Prof. Dr. Ir. H. Feliatra, DEA mulai tanggal 22 Oktober 2012 sampai Oktober 2016. Kemudian Rektor UPP dari November 2016 sampai Oktober 2020 adalah bapak Dr.Adolf Bastian, M. Pd. Dari Oktober 2020 Sampai saat ini Rektor UPP adalah bapak Dr.Hardianto,M.Pd. Yayasan Pembangunan Rokan Hulu telah mengelola Universitas Pasir Pengaraian dengan memiliki 7 Fakultas dengan 18 program studi, yang diharapkan menjadi kontribusi dalam meningkatkan kualitas Sumber Daya Manusia pada sektor industri, pendidikan, pemerintahan dan jasa serta kewirausahaan pada skala regional, nasional dan internasional. Adapun Fakultas dan Program Studi tersebut adalah:
| NO | Fakultas | Program Studi
| 1 | Fakultas Teknik | S1 - Teknik Mesin
| | | S1 - Teknik Sipil
| 2 | Fakultas Ekonomi | S1 - Akuntansi
| | | S1 - Manajemen
| | | S1 - Kewirausahaan
| 3 | Fakultas Pertanian | S1 - Agribisnis
| | | S1 - Agrotekologi
| 4 | Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan | S1 - Pendidikan Matematika
| | | S1 - Pendidikan Bahasa Inggris
| | | S1 - Pendidikan Fisika
| | | S1 - Pendidikan Biologi
| | | S1 - Pendidikan Olahraga
| | | S1 - Pendidikan IPS
| 5 | Fakultas Hukum | S1 - Ilmu Hukum
| 6 | Fakultas Ilmu Komputer | S1 - Teknik Informatika
| | | S1 - Sistem Informasi
| 7 | Fakultas Ilmu Kesehatan | DIII - Kebidanan
| | | S1 - Kebidanan
| 1 | Fakultas Teknik | S1 - Teknik Mesin
| | | S1 - Teknik Sipil
| 2 | Fakultas Ekonomi | S1 - Akuntansi
| | | S1 - Manajemen
| | | S1 - Kewirausahaan
| 3 | Fakultas Pertanian | S1 - Agribisnis
| | | S1 - Agrotekologi
| 4 | Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan | S1 - Pendidikan Matematika
| | | S1 - Pendidikan Bahasa Inggris
| | | S1 - Pendidikan Fisika
| | | S1 - Pendidikan Biologi
| | | S1 - Pendidikan Olahraga
| | | S1 - Pendidikan IPS
| 5 | Fakultas Hukum | S1 - Ilmu Hukum
| 6 | Fakultas Ilmu Komputer | S1 - Teknik Informatika
| | | S1 - Sistem Informasi
| 7 | Fakultas Ilmu Kesehatan | DIII - Kebidanan
| | | S1 - Kebidanan
Dari 18 program studi, yang sudah mendapatkan izin operasional lebih dari 15 program studi yang terakreditasi, sedangkan program studi lainnya baik dalam dalam proses akreditasi dari BAN-PT maupun menunggu hasil evaluasi, selain itu Institusi Universitas Pasir Pengaraian juga sudah mendapatkan akreditasi institusi dari BAN-PT.